治疗方法主要是根据息肉的大小，如果息肉小于2㎝，可以在结肠镜下进行息肉切除，或者使用息肉的基底部结扎术。如果息肉比较大，位置比较高超过2㎝，有恶变可能性的息肉，只能进行规范的开刀手术。
肛门息肉的治疗主要还是需要采取手术来治疗，肛门息肉又可以分为有蒂息肉和无蒂广基息肉两种。对于有蒂息肉，可以在内镜下采取套扎术或者活检钳除，还可以通过高频电凝切除，还可以电灼烧掉。
肛门息肉，此名词表述的不太准确，它一般指直肠息肉或者肛乳头瘤。息肉是发生在黏膜上的肿物，肛门属于皮肤，症状为肛门口随着排便而脱出的包块。多数可以自行回纳到肛门里面去，诊断可以通过做肛门镜检查来明确。治疗以手术切除为主，比较安全有效，在内镜下切除，把息肉根部切除，防止复发。
肛门息肉是肛肠科的常见病，如果病情严重，感染会引起炎症和疼痛。对于肛门息肉的治疗，口服普通药物没有明显的疗效。如果息肉发展过快，或者息肉反复感染，影响肛门清洁，应尽快考虑手术切除。平时，更换儿童内衣以保持肛门清洁，这样可以避免感染。我们应该增加儿童户外照明时间，以提高儿童的免疫力，防止疾病的发生和发展。
小儿肛门息肉是可以采取药物的方式进行保守治疗，但是需要定期进行检查，防止息肉恶化，若出现恶化，病人是需要采取手术治疗，肛门息肉的病人是需要看病人的病理来决定的，如果病人是良性的病变，并没有导致病人出现异常的症状。
小儿肛门息肉药物内服没有明显的疗效，注意观察，如果息肉发展过快，或息肉反复感染，影响肛门清洁，尽早手术切除；平时应勤换小儿内裤，保持肛门清洁，可避免感染的发生；应增加小儿户外光照时间，可提高小儿免疫力，防止疾病的发生发展。肛门息肉，是肛肠科常见的一种疾病，不是怎么严重的疾病，没有什么不适现象，如果严重，会出现感染而致红肿疼痛。