自身抗体一般都是自身免疫病的标志，自身抗体是指针对自身组织，器官、细胞及细胞成分的抗体，自身免疫性疾病中有许多自身抗体，其中最重要的是抗核抗体，另外，抗心磷脂抗体、中性粒细胞胞浆抗体、抗线粒体抗体、抗红细胞抗体、抗血小板抗体、抗内皮细胞抗体、抗神经元抗体、类风湿因子、抗甲状腺球蛋白抗体、抗胰岛素体抗体等也都是自身抗体。
糖尿病自身抗体三项主要是指抗胰岛素自身抗体，胰岛细胞抗体及谷氨酸脱羧酶抗体。这三种抗体是特异性诊断一型糖尿病的依据，因为一型糖尿病主要是由于胰岛b细胞受到了自身免疫的攻击，其中抗胰岛素自身抗体和胰岛细胞抗体，是证明体内发生了自身免疫效应。
胰岛细胞抗体有90%都是出现在胰岛细胞抗体，对病情具有一定的诊断价值，适合从未使用过外源性胰岛素的病人，一般可体检出与胰岛素相结合的自身抗体。抗胰岛素自身抗体的出现与I型糖尿病有一定的关系。
甲状腺抗体是免疫系统对甲状腺自身成分产生的自身抗体，经常测定的包括甲状腺球蛋白抗体、甲状腺微粒体抗体和促甲状腺激素受体抗体。
在甲状腺激素生产过程中，甲状腺需要使用甲状腺球蛋白作为生产线，碘有机化合成甲状腺激素也需要甲状腺微粒体。免疫系统如果不认识甲状腺球蛋白和甲状腺微粒体，就会自认为是敌人而发生反应，通过自身免疫反应产生自身抗体。
糖尿病自身抗体的三个项目包括：
1、最常用的胰岛素自身免疫抗体是胰岛素抗体。如果受检者没有注射过胰岛素，胰岛素抗体阳性则高度怀疑为1型糖尿病；但如果长期服用胰岛素，多年后会出现胰岛素抗体，不足以作为糖尿病分型的指标。
2、谷氨酸脱羧酶抗体，也称为GAD抗体65，也用于鉴别诊断。四种抗体中，抗体持续时间最长，用于糖尿病的分型诊断；
3、胰岛细胞抗体称为ICA，即ICA胰岛细胞抗体。如果胰岛细胞抗体阳性，也反映了机体分泌的抗体本来是用来破坏病毒的，但这个抗体是用来攻击自身的胰岛细胞的，强烈提示可能是1型糖尿病；
甲状腺自身抗体三项包括抗甲状腺过氧化物酶抗体、抗甲状腺球蛋白抗体以及促甲状腺受体抗体。抗甲状腺过氧化酶抗体和抗甲状腺球蛋白抗体，主要是诊断自身免疫性甲状腺炎，也就是桥本式甲状腺炎的重要指标。