糖皮质激素不能长期使用。长期使用糖皮质激素会出现胃肠道反应，容易引起胃部疾病，消化性溃疡等病症的发生。可能会引起痤疮，多毛，骨质疏松，酒糟鼻，毛细血管扩张等。
糖皮质激素的副作用有如果使用的剂量太大、使用的时间太长，就会造成身体水肿、无力、多毛、以及还会引发糖尿病和高血压等。糖皮质激素会引发或者是加重感染，这种药物能够降低身体的抗感染能力，让细菌更容易繁殖、生长和扩散。
长期服用糖皮质激素突然停药，会引起激素反弹，使原有症状加重，应逐渐减量至停用。饮食尽可能广泛多样化，多吃高蛋白优质蛋白食物多吃蔬菜水果。应该避免生冷辛辣等不良刺激。
糖皮质激素乳膏有皮炎平软膏、氟轻松软膏、复方倍氯米松樟脑软膏、丙酸氯倍他索软膏、丁酸氢化可的松软膏、糠酸莫米松软膏等。这些软膏是皮肤科常用的外用药，有抗过敏、消炎、止痒、减轻皮疹等功效。
糖皮质激素失眠可以用中药进行调理。
糖皮质激素使用较多的西药种类，其副作用也比较常见。其中常见的副作用之一是失眠、烦躁和情绪激动。遇到这种情况，可以用黄疸、肉桂分别打开10克水泡服，服用后这些副作用基本上可以消失。因此，对这种激素敏感的患者每次用药都会先服用这一方，晚上不会失眠。对于长期服用激素引起的失眠，用15克黄疸、12克肉桂水煎煮，效果良好。
长期服用糖皮质激素会导致骨质疏松，因为糖皮质激素会影响体内钙的稳态，抑制小肠对钙和磷的吸收，增加肾脏对尿钙的排泄，导致继发性的甲状旁腺功能亢进和体内缺钙，抑制新骨骼合成，影响骨骼新生。