肛瘘手术分为两种，一个为高位肛瘘的挂线疗法，还有一个就是低位肛瘘的直接切除治疗，两者在术后都需要进行温水坐浴，定期换药治疗，时间一般需要一个月左右，手术后不到三周即可痊愈了，痊愈后注意饮食，不要吃辛辣的食物，饮食多注意清淡点比较好的，多注意好休息。
肛瘘是肛周脓肿或痔疮反复感染最后，形肛门外和肛管内两个口相同的感染性窦道。其治疗时间需要根据实际病情而定。要及时选择专业的医院进行检查，并根据检查结果进行科学的针对性治疗。还需要保持良好的心态积极配合治疗。以免造成病情恶化。
一般治疗的时间和严重程度有关的，有的可能在一周到半个月左右的不等，需要定期到医院复查，平时一定要注意个人卫生避免感染，肛瘘的主要原因是肛周脓肿，直肠肛门损伤，肛门裂反复感染等因素导致的。
肛瘘术后的时间的长短，与瘘管的大小，病情的复杂程度，病人的体质情况及手术方法有密切关系，单纯性低位肛瘘，大约需三周左右的时间才能渐愈。忌食有刺激性的食物，如酒类，辣椒、大蒜等辛热之品。术后不宜禁食，应给软质普食，不要因为恐惧大便时疼痛而禁食或少食。宜食蜂蜜，每日清晨空腹服蜂蜜一杯，其有清热补中，润燥滑肠，为通调大便之佳品。多食蔬菜水果，如苹果、香蕉、梨等。
肛瘘多久能痊愈；手术后按时换药，平时注意卫生，勤清洗，便后清洗，一般需要2-4周可以痊愈。建立正常的膳食习惯，因肛瘘的发生与湿热有关，对于油腻饮食，可以内生湿热，所以不宜多吃。养成良好的排便习惯，每日排便后坐浴保持肛门清洁，对预防感染有积极作用。避免一直保持同样姿势，坐着工作的人每隔一小时要能走动三、四分钟。