一般至少一周左右，但会因为年龄、身体素质、病情严重程度、有无并发症、是否合并其他疾病等这些因素而有些不同，具体住院治疗天数还需遵医嘱，肛周脓肿术后要做好肛门周围清洁。以免细菌等再次污染伤口。术后饮食也很重要，要避免辛辣，应多吃蔬果预防便秘。
肛周脓肿术后注意事项包括：无论采用何种手术方式，术后均需注意保持局部卫生，清洁干净后再上药；术后需饮食清淡，忌辛辣和烟酒，保持大便通畅；术后可采用中药泡洗，涂抹药膏。有利于局部伤口愈合和弹性恢复，不容易复发。
肛周脓肿具体分为高位脓肿和低位脓肿，低位脓肿主要是位于肛管括约肌以下水平，对于低位的脓肿及时进行切开引流，术后一周就可以出院。而对于高位脓肿或者深部的脓肿需要进行挂线疗法，手术以后应该坚持每天进行换药，住院的时间就会延长，可以达到两周甚至更长，因为术后换药的目的也是为了预防术后形成肛瘘，促进内口的愈合。
一般是住院一周多，渗出液少了就可以拔了。术后刀口完全愈合需要三到四周，期间要经常换药，要安排好时间。一般是术后一周多要每天便后换药，以后可以隔天一次，再以后隔两天一次，间隔时间根据刀口愈合情况而定。以确保刀口顺利愈合，预防肉芽组织增生过长或者肛门狭窄等情况发生。
一般住院需要两个礼拜左右伤口恢复得比较好了，才可以出院。平时要注意保护好伤口，尽量避免伤口湿水，定时换药，适当多加强营养，多吃点新鲜的水果，蔬菜，辛辣油腻刺激性比较强的食物少吃，尽量避免便秘和大便干硬。