肛瘘手术是将坏死的溃疡创面切开引流，并将病灶完全切除。一般一个星期就可以出院。但是完全愈合周期需要一个月，愈合期间需要定时换药。术后每天能用低浓度高猛酸钾坐浴，还要做好患处消炎，要养成每日通便的习惯。痊愈后有时间应到医院随访，防止肛痿复发。
肛瘘多久能痊愈；手术后按时换药，平时注意卫生，勤清洗，便后清洗，一般需要2-4周可以痊愈。建立正常的膳食习惯，因肛瘘的发生与湿热有关，对于油腻饮食，可以内生湿热，所以不宜多吃。养成良好的排便习惯，每日排便后坐浴保持肛门清洁，对预防感染有积极作用。避免一直保持同样姿势，坐着工作的人每隔一小时要能走动三、四分钟。
正常的肛瘘术后恢复时间一般需要10天到2周左右。那么一般两周左右以后就可以正常的上班和生活。但是如果术前肛瘘检查为高位复杂性肛瘘，或肛瘘的瘘管有多条分支，可能术后的恢复时间需要20天到1个月左右。所以肛瘘手术后恢复时间主要是根据肛瘘术前的病情严重程度而定。
肛瘘多为化脓性感染所致，少数为特异性感染，如结核、克罗恩病、溃疡性结肠炎等感染亦可所致。最佳治疗办法可以手术处理。通常术后需要半月到一月时间恢复，手术观察期间一定要注意饮食生活作息，少吃辛辣刺激的食物，少喝酒，多注意局部的卫生清洗，勤换内裤。
肛瘘位于直肠肛管周围，做手术要切开或者切除，或是挂线，伤口要敞开，所以恢复起来比较慢。因为肛门每天都要排便，所以每天要坐浴，清洗伤口，需要三，四周才能够恢复。比较轻的，可能时间会再短一些，比较严重的肛瘘也要6-8周才能够恢复。
肛瘘手术以后，需要看具体的恢复情况，再考虑是否正常的上班工作。只有肛瘘彻底恢复以后才能够上班的，肛瘘恢复的过程往往都是比较缓慢的，需要创面一点点的，通过换药等方式来自行愈合的。所以时间是不能确定的。