肛门口周围流脓，周期性发作，时有时无，脓液较少。一般不疼，当脓液积存于管腔内引流不畅时，局部胀痛，当脓液流出后疼痛马上减轻。脓液经常刺激瘘口周围皮肤，致肛门皮肤瘙痒或湿疹。肛门口周围有肿块。
肛瘘的症状是会排脓，脓汁粘稠，黄色、味臭；瘘管日久的排脓相对较少，或时有时无，稀淡如水；若脓量增加，则表示新瘘管生成瘘管有时会暂时封闭，不排脓液，从而出现局部肿痛，体温上升。
轻微肛瘘症状，流脓，肛瘘流脓的程度与瘘管的长短、多少是有一定关系的，新生的瘘管流脓较多，分泌物不断的刺激皮肤，出现瘙痒的症状，而且瘘管内的脓液积聚也会出现肿胀疼痛，甚至会引起发烧，而且瘘管外口排出的脓液一般是血性有粘稠性的，比较深的高位肛瘘，还会有粪便和气体排出。
轻度肛瘘的症状有流脓，疼痛，瘙痒，排便不畅等症状，在日常生活中如果不注意饮食的健康经常劳累过度，身体就会出现这样那样的疾病，特别是肛瘘的出现，使得很多病人感到十分的痛苦，而且该疾病一定要手术才能够治疗为此病人一定要有心理准备。
瘘管排脓较多，脓汁粘稠，黄色、味臭；瘘管日久的排脓相对较少，或时有时无，稀淡如水；若脓量增加，则表示新瘘管生成。瘘管有时会暂时封闭，不排脓液，从而出现局部肿痛，体温上升，以后封闭的瘘口破溃，又排出脓液，也可从瘘口排出气体或粪便。