来月经时头痛，通常是由于月经期血清中的雌二醇浓度降低或雌激素刺激泌乳素引起的。若雌二醇浓度降低，导致颅内外血管及子宫血管对某些因素物质更敏感，引起血管张力的变化异常后，就可能引发的头痛。一般随着月经结束后，雌二醇水平恢复正常，头痛也会逐渐缓解。因此月经性的头痛一般是随着月经周期的出现而出现，随着月经的结束而消失。还有一种可能是雌激素刺激泌乳素分泌，会间接刺激前列腺素分泌，而前列腺素作用于血管，也可能引起血管收缩扩张而导致偏头痛。
一般来说，每次来例假头疼，都是因为荷尔蒙分泌失调造成的。
体内的血液循环加快，会引起激素水平的失调，从而引起头痛。来例假的时候，如果头痛比较轻微，可以服用一些活血化瘀的药物，比如逍遥丸。如果在例假期间出现头痛、头晕等症状，建议到医院进行全面的检查，以确定是否存在其他疾病。女性在月经期间要注意饮食健康，避免进食辛辣刺激、油腻、高甜类食物。
来月经时头疼可以吃美托洛尔、舒曲林、氟西汀、氟桂利嗪等药。
月经时头痛是一种偏头痛，头痛可通过针刺、中医辨证治疗，消除诱发因素，保持情绪稳定，避免饮酒。药物治疗可口服美托洛尔等，也可用于预防血管舒张。失眠时可添加舒曲林、氟西汀等抗抑郁药物，如果是紧张性头痛可短期服用，临床上常用的是氟桂利嗪，必要时可以添加止痛药缓解症状，一般非甾体类药物相对较常用。
在月经来临期间头痛，很可能是经期综合症导致的，也可能是有气滞血瘀导致气血不通畅等，建议遵医嘱口服止痛的药物缓解症状，也可以通过按摩热敷等来看看效果，不要熬夜即可。
通常情况下，来月经头痛与雌激素、孕激素水平下降引起精神上和躯体上的不适反应有关，可以通过以下几种方式来改善：
1、调整心态、调整心态、合理膳食、加强营养、避免酗酒、避免饮用咖啡因等。
2、服用药剂。服用正天丸、脑力静胶囊、维生素b6片等都能起到改善经期压力的作用。有严重头疼的患者可以服用布洛芬片进行调理。
3、可以通过中医的针灸和推拿来进行康复训练。