良性卵巢囊肿病程长，囊肿逐渐长大，多无不适症状；而恶性者病程短，囊肿迅速长大，且有时可伴有发热。良性者多为生育期妇女，情况良好；而恶性者发病多见于青春期前少女、青少年或绝经后妇女，病情发展快。
卵巢囊肿有生理性的和病理性的，生理性的是发生在排卵期或是怀孕早期的，是由于体内激素波动造成的，后期是会自行消失，不需进行治疗的。病理性的一般是炎症感染刺激造成的，属于良性的肿瘤。是可以先服用药物保守治疗的，后期观察囊肿的变化，逐渐增大出现混合性包块只要不恶化变异，需要进行手术治疗，一般是进行腹腔镜下剔除术的。
卵巢功能多属于良性的病变，恶变的几率是比较低的，卵巢囊肿大小和边界是否清楚，平时的月经周期是否正常，如果出现了明显并发症等，也可以通过手术的方式来治疗，手术后反复的几率比较低。
卵巢囊肿可以根据症状及时对症治疗控制，有囊肿暂时不要怀小孩子，在卵巢囊肿好转以后再进行怀小孩子是比较安全的，平时注意情绪调节控制，不用太担心，囊肿不会导致不孕不育。
卵巢良性肿瘤一般病程长，生长慢，多为单侧，活动，囊性多见，表面光滑，无腹水，B超检查为液性暗区，边缘清晰。卵巢恶性肿瘤病程短，生长快，多为双侧，实性或囊实性，表面不光滑结节状，常有腹水，多为血性，可查到癌细胞，B超检查回声杂乱，边缘不清晰。
卵巢囊肿表面光滑，体积大小不一，一般小干5cm.可移动，也可以发展成巨大囊肿，可以是单囊肿或多囊，每个囊腔大小不一囊肿增大较慢，病程较长.无腹水是良性。卵巢癌会产生身体不适，有时发热，消瘦快.卵巢癌会肿块增长很快，病程短，肿块表面有结节而且会产生腹水.肿瘤标志物检查会明显升高。