主要病因有：母亲怀孕早期感染流感病毒、风疹病毒；遗传因素；怀孕期间服用镇静药、抗癫痫药、激素类药或大量接受X线照射等。主要表现为出生后上唇和上颚裂开成两瓣或三瓣，唇裂手术时间为生后3个月。腭裂为生后18个月。
唇腭裂的治疗主要是通过整形来恢复口腔内的结构以及面部的畸形。但是选择什么样的手术方式以及手术时间还需要根据唇腭裂的轻重程度来考虑。最终的治疗目的是改善腭裂，恢复软腭的生理功能。术后还需要进行语言的训练来形成正确的发音。长大一些还需要到口腔科进行牙齿的矫正治疗。
唇腭裂的发生和遗传有一定的关系，还和环境因素有关，在妊娠前三个月内，当母体的生理状态受到侵袭或干扰时，就可能影响胚胎颌面部的生长发育。孕期注意定期做孕检，注意休息，保持心情舒畅。
唇腭裂是一种常见的先天性的小儿颌面部的畸形。唇腭裂其实是唇裂和腭裂的统称。那么唇裂就是常说的兔唇，就是上唇裂开，腭裂实质是上颌骨、口腔和鼻腔的隔断有一个裂隙。唇腭裂患儿出生以后需要进行序列的治疗。
对于唇腭裂的原因来讲，引起发育和综合障碍的确切原因或发病机理现在尚未完全明了。大概通过实验和流行病学的观察以及调查结果，可分为多种因素影响的，而非单一因素所致。一般包括遗传因素和环境因素两个方面，并与营养、遗传、环境、内分泌等因素有关。